Protein–RNA interactions for Protein: O14656

TOR1A, Torsin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1AO14656 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TOR1AO14656 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TOR1AO14656 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms