Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F3O00716 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F3O00716 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F3O00716 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F3O00716 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F3O00716 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F3O00716 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F3O00716 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms