Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HIP1O00291 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIP1O00291 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HIP1O00291 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIP1O00291 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIP1O00291 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIP1O00291 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HIP1O00291 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HIP1O00291 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HIP1O00291 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIP1O00291 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HIP1O00291 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HIP1O00291 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HIP1O00291 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HIP1O00291 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms