Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AGPSO00116 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPSO00116 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPSO00116 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPSO00116 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPSO00116 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AGPSO00116 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGPSO00116 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGPSO00116 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AGPSO00116 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AGPSO00116 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AGPSO00116 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AGPSO00116 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGPSO00116 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGPSO00116 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms