Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
J3KR12 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
J3KR12 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
J3KR12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
J3KR12 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
J3KR12 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KR12 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KR12 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KR12 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KR12 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KR12 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KR12 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
J3KR12 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3KR12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3KR12 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
J3KR12 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
J3KR12 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
J3KR12 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms