Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
I3L3M4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
I3L3M4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
I3L3M4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
I3L3M4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
I3L3M4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms