Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms