Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H7C0C1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0C1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
H7C0C1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
H7C0C1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
H7C0C1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0C1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0C1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0C1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0C1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0C1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0C1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
H7C0C1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
H7C0C1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
H7C0C1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
H7C0C1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
H7C0C1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms