Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
E9PMD0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
E9PMD0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
E9PMD0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
E9PMD0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PMD0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PMD0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PMD0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
E9PMD0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E9PMD0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E9PMD0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E9PMD0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
E9PMD0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms