Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L13C9JLJ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L13C9JLJ4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms