Protein–RNA interactions for Protein: B7Z1M9

C2CD4D, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4DB7Z1M9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C2CD4DB7Z1M9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C2CD4DB7Z1M9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C2CD4DB7Z1M9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms