Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DGG1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
B4DGG1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DGG1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DGG1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DGG1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DGG1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DGG1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
B4DGG1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
B4DGG1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
B4DGG1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
B4DGG1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
B4DGG1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4DGG1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
B4DGG1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
B4DGG1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
B4DGG1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
B4DGG1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms