Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMCO5BA8MYB1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
TMCO5BA8MYB1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms