Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WASHC1A8K0Z3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WASHC1A8K0Z3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms