Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF839A8K0R7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF839A8K0R7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms