Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMIM23A6NLE4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMIM23A6NLE4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms