Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC85CA6NKD9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC85CA6NKD9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85CA6NKD9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms