Protein–RNA interactions for Protein: A6NIR3

AGAP5, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP5A6NIR3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AGAP5A6NIR3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AGAP5A6NIR3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms