Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC69A6NI79 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC69A6NI79 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms