Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCAF2A6NFQ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCAF2A6NFQ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCAF2A6NFQ2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms