Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GOLGA6BA6NDN3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GOLGA6BA6NDN3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms