Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PALM3A6NDB9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PALM3A6NDB9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PALM3A6NDB9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms