Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YY99

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YY99 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
A0A0J9YY99 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YY99 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YY99 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YY99 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YY99 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
A0A0J9YY99 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms