Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
A0A087WWV3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
A0A087WWV3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms