Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 IQCD-202ENST00000416617 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FAM13C-201ENST00000422313 1963 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 PRAMEF18-202ENST00000624297 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 TYR-201ENST00000263321 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 TIAM2-212ENST00000529824 5262 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 BDNF-202ENST00000356660 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 BDNF-218ENST00000533246 4000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 PDE6B-212ENST00000496514 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 ST5-207ENST00000526099 2404 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 LILRB3-202ENST00000346401 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 UBTFL8-201ENST00000426903 2112 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 HMOX2-203ENST00000406590 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 PLEKHG4-204ENST00000427155 4455 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 EIF3C-204ENST00000564243 2870 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 ZFAT-202ENST00000429442 4421 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AC138761.4-202ENST00000577956 2552 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 STIM1-218ENST00000533977 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 ITGB8-205ENST00000537992 3420 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 SCAMP5-203ENST00000562212 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 DDX3P1-201ENST00000418231 1950 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 INAVA-201ENST00000367342 4298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 IL1R2-201ENST00000332549 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 MAMLD1-201ENST00000262858 4607 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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SCN2BO60939 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 CEP63-204ENST00000383229 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 UNKL-210ENST00000508903 3430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FGD3-202ENST00000375482 3321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 BCAR3-203ENST00000370244 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 LVRN-202ENST00000395528 4544 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AC005537.1-203ENST00000629291 1748 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 BCAS1-201ENST00000371435 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 AC007277.1-201ENST00000428156 2189 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 PITX2-212ENST00000614423 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 DHRS12-202ENST00000280056 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 ATL2-206ENST00000419554 2335 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 PRKAG3-203ENST00000439262 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 GOLGA6L10-208ENST00000619556 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 C10orf128-201ENST00000374148 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SCN2BO60939 LDLRAD1-204ENST00000545928 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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