Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF142-201ENST00000411696 5926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC096637.2-202ENST00000421933 1846 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PACSIN1-201ENST00000244458 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PACSIN1-202ENST00000374043 4229 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PTGER4P2-CDK2AP2P2-201ENST00000619442 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DRAXIN-201ENST00000294485 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C4orf3-201ENST00000399075 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZC3HC1-203ENST00000360708 1676 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZFAT-216ENST00000523399 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ATP8B2-202ENST00000368489 5861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 WDR47-202ENST00000361054 4115 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 STOML3-202ENST00000423210 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 DGCR8-202ENST00000383024 4419 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PAX8-AS1-205ENST00000437551 2390 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC015920.1-201ENST00000624645 2450 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CFAP97-202ENST00000458385 4852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RAPGEF3-204ENST00000405493 5751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZSCAN29-204ENST00000562072 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 WTAPP1-202ENST00000525739 2642 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NET1-201ENST00000355029 3402 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CFAP65-207ENST00000441968 3416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MCM5-201ENST00000216122 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SHANK2-AS3-201ENST00000307548 1683 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ARF1-201ENST00000272102 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 H2AFY-201ENST00000304332 1881 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TCN2-205ENST00000450638 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SHANK2-AS1-201ENST00000429561 2252 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 C3orf20-201ENST00000253697 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PDE6C-201ENST00000371447 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NPAS3-205ENST00000547068 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AP005242.4-201ENST00000623533 2529 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC117529.1-201ENST00000505789 2023 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TMEM161B-213ENST00000514135 2035 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NRAP-201ENST00000359988 5580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC090061.1-201ENST00000500695 1733 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 EFCAB6-201ENST00000262726 4869 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PCDHGA1-201ENST00000378105 4069 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CD163L1-201ENST00000313599 4615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 IKZF1-201ENST00000331340 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 LCTL-202ENST00000537670 2552 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 EOMES-203ENST00000461503 2080 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 THRIL-201ENST00000627370 1977 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 NIPAL1-201ENST00000295461 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF629-201ENST00000262525 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SPIB-205ENST00000595883 3791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 S100PBP-202ENST00000373475 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SDAD1P1-201ENST00000519902 3174 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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