Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FAM95B1-211ENST00000592053 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AL669942.1-203ENST00000610972 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC092159.2-201ENST00000445418 1943 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 TP53TG5-201ENST00000372726 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 ZNF461-204ENST00000588268 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 DBH-202ENST00000393056 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SCO1-201ENST00000255390 9612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 AC122129.1-201ENST00000354746 1815 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 ETF1-202ENST00000499810 3874 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
NICN1Q9BSH3 TYR-201ENST00000263321 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GEMIN8-202ENST00000380523 1682 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AP005242.4-201ENST00000623533 2529 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DCTN1-206ENST00000409868 4202 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MAF1-204ENST00000532522 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC00694-204ENST00000637612 1059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 IQGAP3-201ENST00000361170 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DDX4-201ENST00000353507 2778 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 L3MBTL3-207ENST00000529410 4518 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MADD-206ENST00000402192 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RNF144A-AS1-201ENST00000418970 2374 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NCALD-202ENST00000311028 3655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ANKZF1-203ENST00000410034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HYDIN-209ENST00000538248 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GK-207ENST00000427190 4573 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SMOC1-202ENST00000381280 3666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SCN5A-209ENST00000451551 8343 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GRAMD1B-201ENST00000322282 2571 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SLCO2A1-201ENST00000310926 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AL591643.1-201ENST00000561587 1900 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LILRB4-202ENST00000391733 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ACTG1-216ENST00000615544 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GMPR2-202ENST00000355299 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ZFYVE27-207ENST00000423811 3045 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 LINC01556-201ENST00000377186 466 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KRT18P26-201ENST00000454475 1281 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC113340.1-201ENST00000475257 636 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 AF274856.1-202ENST00000509345 871 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NICN1Q9BSH3 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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