Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
U3KQE9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
U3KQE9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
U3KQE9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQE9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
U3KQE9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
U3KQE9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
U3KQE9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
U3KQE9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
U3KQE9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms