Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1Q9Y6S9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms