Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
MAP3K4Q9Y6R4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
MAP3K4Q9Y6R4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP3K4Q9Y6R4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms