Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y664

KPTN, KICSTOR complex protein kaptin, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPTNQ9Y664 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KPTNQ9Y664 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KPTNQ9Y664 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms