Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HDGFL3Q9Y3E1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDGFL3Q9Y3E1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms