Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.18■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC51.17■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC51.17■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC51.16■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.15■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC51.15■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.15■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC51.14■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC51.13■■■■■ 5.78
NISCHQ9Y2I1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC51.13■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC51.13■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC51.12■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.11■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC51.1■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC51.1■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC51.1■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC51.09■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC51.09■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.08■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC51.08■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.08■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC51.08■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.08■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC51.07■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC51.07■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.07■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC51.07■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.77
NISCHQ9Y2I1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.06■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC51.05■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC51.05■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC51.04■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC51.01■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
NISCHQ9Y2I1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms