Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC3AQ9Y2H6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms