Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FARSAQ9Y285 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FARSAQ9Y285 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FARSAQ9Y285 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms