Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNNQ9UQP3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNQ9UQP3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms