Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTN6Q9UQ52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CNTN6Q9UQ52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNTN6Q9UQ52 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms