Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRPF3Q9ULD4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRPF3Q9ULD4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms