Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKLN1Q9UL63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKLN1Q9UL63 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms