Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MID2Q9UJV3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MID2Q9UJV3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms