Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SALL4Q9UJQ4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SALL4Q9UJQ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms