Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPUSD1Q9UJJ7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RPUSD1Q9UJJ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms