Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MBD1Q9UIS9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MBD1Q9UIS9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms