Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCOCQ9UIL1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SCOCQ9UIL1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SCOCQ9UIL1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCOCQ9UIL1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms