Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DDX25Q9UHL0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX25Q9UHL0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX25Q9UHL0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms