Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NPC1L1Q9UHC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NPC1L1Q9UHC9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NPC1L1Q9UHC9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms