Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABBR1Q9UBS5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABBR1Q9UBS5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms