Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KLHL42Q9P2K6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL42Q9P2K6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms