Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDH10Q9P2E7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCDH10Q9P2E7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCDH10Q9P2E7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms