Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHPF2Q9P2E5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHPF2Q9P2E5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHPF2Q9P2E5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms